Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc9Q8BJN4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc9Q8BJN4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms