Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMIM5Q71RC9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM5Q71RC9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM5Q71RC9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms