Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf1Q64213 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms