Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf9Q61179 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf9Q61179 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms