Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Traf3ip1Q149C2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms