Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms