Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSC2Q02487 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC2Q02487 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms