Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 BTS1YPL069C 1008 nt2.15□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 MUM2YBR057C 1101 nt2.15□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 DNA2YHR164C 4569 nt2.15□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 UTP6YDR449C 1323 nt2.15□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 ANR2YKL047W 1551 nt2.15□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 snR70snR70 164 nt2.14□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 MRP10YDL045W-A 288 nt2.14□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 PCL7YIL050W 858 nt2.14□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 OMA1YKR087C 1038 nt2.14□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 EMC6YLL014W 327 nt2.14□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YLR311CYLR311C 348 nt2.14□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YNL234WYNL234W 1281 nt2.14□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 RPL25YOL127W 429 nt2.14□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 RFC5YBR087W 1065 nt2.14□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 KAR4YCL055W 1008 nt2.14□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 SEN54YPL083C 1404 nt2.14□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 SAP185YJL098W 3177 nt2.13□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 TIM9YEL020W-A 264 nt2.13□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 MRM2YGL136C 963 nt2.13□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YGL138CYGL138C 1038 nt2.13□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.13□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 NNT1YLR285W 786 nt2.13□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.13□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 TPT1YOL102C 693 nt2.13□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 SSP2YOR242C 1116 nt2.13□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.13□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 AGE1YDR524C 1449 nt2.13□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 TOF1YNL273W 3717 nt2.13□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 UBP15YMR304W 3693 nt2.13□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YKL075CYKL075C 1353 nt2.12□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YJR061WYJR061W 2808 nt2.12□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 GET1YGL020C 708 nt2.12□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.12□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YJR020WYJR020W 333 nt2.12□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YNL035CYNL035C 1170 nt2.12□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt2.12□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 GPI2YPL076W 843 nt2.12□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 ISU1YPL135W 498 nt2.12□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 SCY1YGL083W 2415 nt2.12□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 PDR3YBL005W 2931 nt2.12□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 RRP14YKL082C 1305 nt2.12□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 AVT5YBL089W 1380 nt2.11□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 PSP1YDR505C 2526 nt2.11□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 ADH4YGL256W 1149 nt2.11□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 RSR1YGR152C 819 nt2.11□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 SAW1YAL027W 786 nt2.11□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.11□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 SED5YLR026C 1023 nt2.11□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YNL046WYNL046W 519 nt2.11□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YJL181WYJL181W 1836 nt2.11□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 TFC3YAL001C 3483 nt2.11□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 MCD1YDL003W 1701 nt2.11□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 TMN3YER113C 2121 nt2.11□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 SSD1YDR293C 3753 nt2.1□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YNL018CYNL018C 1839 nt2.1□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 RPL35BYDL136W 363 nt2.1□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 ISC10YER180C 804 nt2.1□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 DDI2YFL061W 678 nt2.1□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.1□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YIL161WYIL161W 708 nt2.1□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YDR186CYDR186C 2634 nt2.09□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 ARI1YGL157W 1044 nt2.09□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YGR050CYGR050C 357 nt2.09□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 COG2YGR120C 789 nt2.09□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 SPO20YMR017W 1194 nt2.09□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.09□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YOR203WYOR203W 354 nt2.09□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YOR387CYOR387C 621 nt2.09□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 HAT1YPL001W 1125 nt2.09□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 LTP1YPR073C 486 nt2.09□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 AIM4YBR194W 372 nt2.09□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 USO1YDL058W 5373 nt2.09□□□□□ -2.07
NUP49Q02199 YDR061WYDR061W 1620 nt2.09□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YNL193WYNL193W 1677 nt2.09□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YFH1YDL120W 525 nt2.08□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 RRG1YDR065W 1098 nt2.08□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YDR290WYDR290W 330 nt2.08□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 RPS25AYGR027C 327 nt2.08□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 AYR1YIL124W 894 nt2.08□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 SFT1YKL006C-A 294 nt2.08□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YLL044WYLL044W 447 nt2.08□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt2.08□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YBL055CYBL055C 1257 nt2.08□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 FPR1YNL135C 345 nt2.08□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 snR43snR43 209 nt2.08□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 SPP41YDR464W 4308 nt2.08□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 WHI3YNL197C 1986 nt2.07□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 ROY1YMR258C 1662 nt2.07□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 DBF20YPR111W 1695 nt2.07□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 ECM11YDR446W 909 nt2.07□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.07□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 POP6YGR030C 477 nt2.07□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 MPC3YGR243W 441 nt2.07□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 NOP19YGR251W 591 nt2.07□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 TEX1YNL253W 1269 nt2.07□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 IRC14YOR135C 342 nt2.07□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 PRM4YPL156C 855 nt2.07□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YLR108CYLR108C 1458 nt2.07□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 STH1YIL126W 4080 nt2.07□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 APC5YOR249C 2058 nt2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms