Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gjb2Q00977 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb2Q00977 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms