Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SeleQ00690 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SeleQ00690 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SeleQ00690 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SeleQ00690 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SeleQ00690 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SeleQ00690 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SeleQ00690 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SeleQ00690 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SeleQ00690 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SeleQ00690 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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