Protein–RNA interactions for Protein: Q00322

Cebpd, CCAAT/enhancer-binding protein delta, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpdQ00322 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CebpdQ00322 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CebpdQ00322 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms