Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl23aP62751 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms