Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copz1P61924 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms