Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pcbp4P57724 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pcbp4P57724 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms