Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PctpP53808 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PctpP53808 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PctpP53808 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PctpP53808 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PctpP53808 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PctpP53808 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PctpP53808 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PctpP53808 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PctpP53808 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PctpP53808 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PctpP53808 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PctpP53808 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PctpP53808 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PctpP53808 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PctpP53808 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PctpP53808 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PctpP53808 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PctpP53808 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PctpP53808 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PctpP53808 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PctpP53808 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PctpP53808 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PctpP53808 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PctpP53808 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PctpP53808 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PctpP53808 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PctpP53808 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PctpP53808 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PctpP53808 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PctpP53808 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PctpP53808 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PctpP53808 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PctpP53808 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PctpP53808 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PctpP53808 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PctpP53808 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PctpP53808 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PctpP53808 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms