Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms