Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgfb3P17125 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgfb3P17125 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms