Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl1P12850 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms