Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifna9P09235 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna9P09235 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms