Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh1P04444 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms