Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lancl1O89112 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lancl1O89112 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms