Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Brd7O88665 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms