Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm28305F6U473 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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