Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Rnf165E9QAU8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Rnf165E9QAU8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Rnf165E9QAU8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf165E9QAU8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Rnf165E9QAU8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Rnf165E9QAU8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Rnf165E9QAU8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Rnf165E9QAU8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Rnf165E9QAU8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Rnf165E9QAU8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Rnf165E9QAU8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Rnf165E9QAU8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Rnf165E9QAU8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf165E9QAU8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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