Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srsf11E9Q6E5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf11E9Q6E5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms