Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtproE9Q612 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtproE9Q612 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtproE9Q612 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtproE9Q612 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtproE9Q612 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtproE9Q612 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtproE9Q612 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms