Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b2E9Q3E1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms