Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931429L15RikE9PVU2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931429L15RikE9PVU2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931429L15RikE9PVU2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931429L15RikE9PVU2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931429L15RikE9PVU2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931429L15RikE9PVU2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4931429L15RikE9PVU2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms