Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc8D3YZV8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc8D3YZV8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms