Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Palm3A2TJV2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Palm3A2TJV2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Palm3A2TJV2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms