Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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