Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprkP35822 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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PtprkP35822 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprkP35822 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprkP35822 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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