Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Egf-202ENSMUST00000197079 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd1P40201 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Phactr4-203ENSMUST00000102568 4614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Prkar2b-203ENSMUST00000146865 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.1 ms