Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm44684-201ENSMUST00000205388 2926 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Fam217a-201ENSMUST00000021851 2402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp9yF8VPU6 Gm42519-201ENSMUST00000199282 3656 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Pes1-202ENSMUST00000109985 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Pes1-201ENSMUST00000020705 2911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm44641-201ENSMUST00000152342 323 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Zfp563-201ENSMUST00000131722 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Il1rl2-201ENSMUST00000095020 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Serpina3f-203ENSMUST00000167049 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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