Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc2Q9Z2H7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc2Q9Z2H7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms