Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna2d3Q9Z1L5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna2d3Q9Z1L5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms