Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms