Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP20Q9Y2K6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP20Q9Y2K6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms