Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkp3Q9QY23 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms