Protein–RNA interactions for Protein: Q9P278

FNIP2, Folliculin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP2Q9P278 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FNIP2Q9P278 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNIP2Q9P278 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms