Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms