Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPF2Q9HAU5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms