Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnft1Q9DCN7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms