Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eif3fQ9DCH4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms