Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8M4

Rpl7l1, 60S ribosomal protein L7-like 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl7l1Q9D8M4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl7l1Q9D8M4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl7l1Q9D8M4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms