Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a4cQ9D3F6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms