Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRW3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRW3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRW3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9CRW3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRW3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms