Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab5aQ9CQD1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5aQ9CQD1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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