Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pagr1aQ99L02 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1aQ99L02 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms