Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMG1Q96Q15 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMG1Q96Q15 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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